Publicatiedatum: 10 november 2021
Universiteit: Universiteit Utrecht
ISBN: 978-94-6423-458-9

Cyclin-dependent kinase inhibitors in cancer: bioanalysis and pharmacokinetics

Samenvatting

Hoofdstuk 4 rapporteert een snelle bioanalytische methode voor de gelijktijdige
kwantificering van irinotecan en SN-38 in muisplasma en weefselhomogenaten met
behulp van High-Performance vloeistofchromatografie met Fluorescentiedetectie
(HPLC-FL). Deze methode is geoptimaliseerd om specifiek preklinische studies van het
metabolisme van irinotecan in SN-38 door carboxylesterase-enzymen te ondersteunen.
De selectiviteit, lineariteit, nauwkeurigheid en precisie van de methode in het
concentratiebereik van 7,5 tot 1500 ng/mL voor irinotecan en van 5 tot 1000 ng/mL
voor SN-38 werd aangetoond. Ten slotte is de toepasbaarheid van deze methode in
een farmacokinetische studie van irinotecan en SN-38 met behulp in vivo muismodellen
bewezen.

Deel II: De impact van geneesmiddeltransporters en metaboliserende enzymen
op de farmacokinetiek van cycline-afhankelijke kinaseremmers
Geneesmiddeltransporters en geneesmiddel metaboliserende enzymen kunnen de
dispositie van substraatgeneesmiddelen beïnvloeden met klinisch relevante
(farmacodynamische) gevolgen. Dus, met behulp van in vitro studies en verschillende
genetisch gemodificeerde muismodellen, onderzoekt deel II van dit proefschrift de rol
van efflux- (ABCBN en ABCG2) en influxtransporters (OATPN) en cytochroom P4SO 3A
(CYPPA) enzymen in de farmacokinetiek en weefseldistributie van CDK-remmers.

Hoofdstuk 5 onderzoekt de effecten van de efflux-transporters ABCBN en ABCG2 en
van CYPPA op de farmacokinetiek van de CDK4/6 remmer ribociclib. In vitro werd
ribociclib efficiënt getransporteerd door humaan ABCBN. In vivo werd de
hersenpenetratie van ribociclib drastisch beperkt door ABCBN in de bloed-
hersenbarrière, maar gelijktijdige toediening van elacridar kon dit proces volledig
omkeren. De resultaten suggereerden verder dat ABCBN een belangrijke rol zou kunnen
spelen bij de eliminatie van ribociclib. Bovendien toonde deze studie aan dat humaan
CYPPA4 ribociclib uitgebreid kan metaboliseren en de orale biologische beschikbaarheid
ervan sterk kan beperken. De inzichten uit deze studie kunnen nuttig zijn om de
klinische toepassing van ribociclib verder te optimaliseren, met name voor de
behandeling van (uitgezaaide) hersentumoren.

Hoofdstuk 6 onderzoekt of de actieve metabolieten van abemaciclib (M2, M2O en MN8)
substraten zijn van de effluxtransporters ABCBN en ABCG2. Daarnaast bekijkt dit
hoofdstuk de impact van deze transporters en van CYPPA op de farmacokinetiek en
weefseldistributie van abemaciclib en zijn actieve metabolieten. In vitro werd
abemaciclib efficiënt getransporteerd door humaan ABCBN en muis Abcg2, en in
geringe mate door humaan ABCG2, en de actieve metabolieten waren zelfs betere
transportsubstraten van deze effluxtransporters. ABCBN en ABCG2 hadden geen
invloed op de plasmablootstelling van abemaciclib en M2O, maar de AUC en de C
0-24h max
van M2 namen significant toe in de afwezigheid van Abcb1a/1b en Abcg2, waarbij
Abcb1a/1b een dominante rol leek te spelen. Bovendien nam de hersenpenetratie van

abemaciclib, M2 en M2O dramatisch toe, respectievelijk (ten minste) 25-, 4- en 60-voudig
wanneer beide transporters waren geïnactiveerd, en in mindere mate bij de
enkelvoudige Abcb1- of Abcg2-deficiënte muizen. Ook was de herwinning van
abemaciclib en zijn metabolieten vanuit de inhoud van de dunne darm sterk verminderd
bij Abcb1a/1b;Abcg2 muizen, en deze effecten waren eveneens minder uitgesproken
-/-
bij de single knock-out muizen. Onze resultaten laten zien dat Abcb1a/1b en Abcg2
samen de hersenpenetratie van abemaciclib en zijn actieve metabolieten beperken,
en ook dat ze deelnemen aan de hepatobiliaire of directe intestinale eliminatie van
deze verbindingen. Daarnaast verminderde het humane CYPPA4 de abemaciclib plasma
AUC en de C met respectievelijk 7,5- en 5,6-voud drastisch, en het bleek actiever
0-24h max
te zijn in de vorming van M2 en M2O dan het muis Cyp3a. De inzichten die in deze
studie zijn verkregen kunnen helpen om de klinische ontwikkeling van abemaciclib te
optimaliseren, met name voor de behandeling van hersentumoren.

Hoofdstuk 7 onderzoekt de rol van de multidrug efflux en uptake transporters ABCBN,
ABCG2 en OATPNA/1B, en het geneesmiddelmetaboliserende enzym CYPPA in de
dispositie van milciclib. In vitro werd milciclib getransporteerd door muis Abcg2. De
plasmablootstelling aan milciclib werd niet significant beïnvloed door effluxtransporters.
De Oatp1a/1b opnametransporter had slechts een kleine invloed op de milciclib plasma
AUC en C . Milciclib vertoonde een goede hersenpenetratie, zelfs bij wildtype
0-24h max
muizen (hersen-tot-plasmaverhouding van 1,2), maar dit werd verder verhoogd met
een factor 5,2 wanneer zowel Abcb1 als Abcg2 waren geïnactiveerd, en in mindere
mate bij enkelvoudige Abcb1- of Abcg2 -deficiënte muizen. De plasma-AUC van
0-8h
milciclib nam 1,9-voudig toe in Cyp3a -muizen, maar nam slechts 1,3-voudig af na
−/−
overexpressie van humaan CYPPA4. Onze gegevens geven dus aan dat ABCBN en
ABCG2 samen de penetratie van milciclib in de hersenen beperken. De geringe impact
van OATPN en CYPPA zou klinisch gunstig kunnen zijn voor milciclib, aangezien het
risico op onbedoelde geneesmiddelinteracties of interindividuele variatie in CYPPA4-
activiteit wordt verminderd.

Deel III: Klinische farmacokinetiek en farmacodynamiek van de cycline-
afhankelijke kinaseremmers
Ten slotte wordt in Hoofdstuk 8 de klinische farmacokinetiek en farmacodynamiek
van de goedgekeurde CDK4/6-remmers (palbociclib, ribociclib en abemaciclib)
besproken. Hier wordt de farmacokinetiek van deze geneesmiddelen in normale en
specifieke populaties beschreven, evenals enkele extrinsieke factoren die hierop van S
invloed zijn, waaronder het voedseleffect en de interactie met andere geneesmiddelen.
Overeenkomsten tussen de farmacokinetiek van deze geneesmiddelen omvatten hun
uitgebreide metabolisme door CYPPA4, hun hersenpenetratie beperkt door
effluxtransporters en hun grote interindividuele variabiliteit in blootstelling. Verder
belicht dit hoofdstuk de blootstelling-respons en blootstelling-toxiciteitsrelaties.
Consistent voor al deze geneesmiddelen wordt hoge blootstelling geassocieerd met

een verhoogd risico op neutropenie, en voor ribociclib ook met gecorrigeerde QT-
verlenging. Voor abemaciclib is een duidelijke blootstelling-werkzaamheidsrelatie
beschreven, terwijl voor palbociclib en ribociclib blootstelling-responsanalyses nog
geen uitsluitsel hebben kunnen geven.

Concluderend kunnen de inzichten in verschillende aspecten van de CDK-remmers
beschreven in dit proefschrift van nut zijn om het klinische gebruik van abemaciclib,
palbociclib en ribociclib te optimaliseren. Bovendien kan dit mogelijk bijdragen aan de
verdere ontwikkeling en toepassing van deze geneesmiddelen en milciclib. Uiteindelijk
kan deze informatie hopelijk leiden tot CDK-behandelingen met verbeterde
werkzaamheid en veiligheid.

Resumen en español

Resumen en español

El cáncer continúa siendo un problema de salud mundial, y se espera que su incidencia
y mortalidad aumenten en los próximos años. Los nuevos tratamientos contra el cáncer
se han enfocado en el desarrollo de fármacos de terapia molecular dirigida, los cuales
han demostrado tener una mayor eficacia y una toxicidad reducida comparadas con
los fármacos citotóxicos tradicionales. Las quinasas dependientes de ciclina (CDKs)
han sido reconocidas como blancos potenciales para tratamientos contra el cáncer,
debido a que éstas, cuando son activadas por ciclinas, pueden controlar putos críticos
del ciclo celular. Hasta ahora, tres fármacos que inhiben selectivamente a CDK4 y CDKS
(palbociclib, ribociclib y abemaciclib) han sido aprobados por agencias regulatorias, y
actualmente están indicados para el tratamiento de cáncer avanzado o metastásico
de mama. Asimismo, otros inhibidores de CDK con diferente especificidad están siendo
investigados en estudios clínicos.

Esta tesis aborda varios aspectos farmacológicos de los inhibidores de CDK, incluyendo
su bioanálisis (Parte I), farmacocinética preclínica (Parte II) y clínica (Parte III),
enfocándose principalmente en los inhibidores de CDK4/6 ya aprobados: abemaciclib,
palbociclib y ribociclib. Asimismo, esta tesis también abarca milciclib, un fármaco
inhibidor de CDK2 que actualmente se encuentra en investigación clínica para el
tratamiento de algunos cánceres.

Parte I: bioanálisis de los inhibidores de quinasas dependientes de ciclina
Debido a que los métodos bioanalíticos son esenciales y críticos para dirigir y realizar
apropiadamente estudios preclínicos y clínicos con fármacos, la parte I de esta tesis
se enfoca en el desarrollo y validación de métodos bioanalíticos para el análisis
cuantitativo de los inhibidores de CDK. La validación de estos métodos se realizó
siguiendo las guías de validación de la Administración de Alimentos y Medicamentos
(FDA) de Estados Unidos y de la Agencia Europea de Medicamentos (EMA). Los métodos
bioanalíticos descritos en la parte I de esta tesis se usaron para dar soporte a los
estudios preclínicos realizados en la parte II.

El capítulo 1 describe el desarrollo y la validación de un método bioanalítico para la
cuantificación de los tres inhibidores de CDK4/6 aprobados (abemaciclib, palbociclib
y ribociclib) en matrices biológicas humanas y murinas usando cromatografía de
líquidos con espectrometría de masas en tándem (LC-MS/MS). Este método fue
completamente validado en plasma humano y parcialmente validado en fluidos
murinos, incluyendo plasma y tejidos homogeneizados de hígado, riñón, bazo, cerebro
e intestino delgado. Para evaluar el desempeño del método en los tejidos
homogeneizados, se utilizó una estrategia “fit-for-purpose” fue usada. El método
resultó ser lineal, exacto y preciso para la cuantificación de abemaciclib, palbociclib y
ribociclib en todas las matrices biológicas. También, en este capítulo se examinó la
estabilidad de los tres analitos en todas las matrices biológicas en diferentes
condiciones de almacenamiento y de procesamiento, en donde palbociclib y ribociclib

Resumen en español

resultaron ser inestables en ciertos tejidos homogeneizados, por lo que las condiciones
fueron modificadas con la finalidad de incrementar la estabilidad de almacenamiento
y procesamiento de la muestra. La aplicabilidad de este método fue demostrada a
través de un estudio de farmacocinética preclínica de ribociclib, en donde se detectó
un nuevo metabolito con la misma transición m/z que el fármaco.

Por otra parte, en humanos, el metabolismo de abemaciclib conlleva a la formación
de tres metabolitos activos (M2, M2O y MN8), cuya potencia, que es comparable a la
de abemaciclib, y abundancia relativa en plasma humano, hacen que estos compuestos
sean de importancia clínica, ya que probablemente contribuyen, en general, a la eficacia
y seguridad clínicas de abemaciclib. Por consiguiente, el método presentado en el
capítulo 2 incluye el bioanálisis simultaneo de estos metabolitos y abemaciclib,
mediante el uso de un método optimizado por cromatografía de líquidos acoplado a
espectrometría de masas en tándem (UHPLC-MS/MS). Mientras que para la
cuantificación en plasma humano se realizó una validación completa de este método,
en plasma murino el método fue parcialmente validado. Este método fue exitosamente
aplicado en un estudio de farmacocinética preclínica, en donde se identificaron y
cuantificaron abemaciclib y sus metabolitos activos, encontrándose diferencias
interespecie entre las matrices humanas y murinas, especialmente en la formación de
M2O, donde se detectaron isómeros de este compuesto en plasma murino, pero no
en plasma humano, lo cual fue confirmado mediante un análisis de espectrometría
de masas de alta resolución.

Posteriormente, en el capítulo 3 se expone un método versátil basado en LC-MS/MS
para el análisis cuantitativo de milciclib en múltiples matrices biológicas, con la finalidad
de contribuir a su desarrollo clínico y preclínico. Para esto, se seleccionó un rango
amplio de concentraciones y el método fue validado en varias matrices biológicas,
incluyendo plasma humano y murino, y homogeneizados de cerebro, riñón, hígado,
intestino delgado y bazo de ratón, además de medio de cultivo celular. Se realizó una
validación completa del método en plasma humano y una validación parcial en las
otras matrices biológicas. El pretratamiento de la muestra utilizado produjo una
extracción eficiente del analito, logrando entre un 95 y 100% de recobro. El uso de
plasma humano como matriz sustituta para cuantificar milciclib en medio de cultivo
celular y en matrices biológicas de ratón resultó con precisión y exactitud aceptables,
aunque para las muestras en medio de cultivo celular fue necesario diluirlas con
plasma humano antes del pretratamiento de la muestra. Todos los parámetros de S
desempeño del método cumplieron con el criterio de aceptación recomendado por
las guías de validación, excepto el carry-over, el cual fue ligeramente mayor (22.9% del
límite de cuantificación) del límite recomendado (20%), por consiguiente, se tomaron
medidas adicionales para asegurar la integridad de los resultados. Adicionalmente, se
evaluó la estabilidad de milciclib en todas las matrices biológicas, donde algunas
inestabilidades del analito fueron encontradas en algunas matrices bajo ciertas

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condiciones, por lo que para muestras en estas matrices se incluyeron recomendaciones
específicas para su almacenamiento y procesamiento.

En el capítulo 4 se reporta un método bioanalítico rápido para la cuantificación
simultánea de irinotecan y SN-38 en plasma y tejidos homogeneizados de ratón usando
cromatografía de líquidos de alta eficiencia con detector de fluorescencia (HPLC-FL).
Este método fue optimizado para aplicarse específicamente en estudios preclínicos
sobre la conversión de irinotecan a SN-38 por medio de las enzimas carboxilesterasas.
Se demostró la selectividad, linealidad, exactitud y precisión del método en un rango
de concentraciones de 7.5 a 1500 ng/mL y de 5 a 1000 ng/mL para irinotecan y SN-38,
respectivamente. Finalmente, se mostró la aplicabilidad del método en un estudio
farmacocinético de irinotecan y SN-38 usando modelos in vivo en ratones.

Parte II: Efecto de los transportadores y enzimas metabolizadoras de fármacos
en la farmacocinética de los inhibidores de quinasas dependiente de ciclina
Los transportadores de membrana y las enzimas metabolizadoras de fármacos pueden
influir en la disposición en el organismo de fármacos sustrato, y pueden llegar a tener
consecuencias farmacodinámicas clínicamente relevantes. Por lo tanto, la parte II de
esta tesis investiga la función de los transportadores de eflujo (ABCBN y ABCG2) e
influjo (OATPN) y de la enzima citocromo P4SO 3A (CYPPA) en la farmacocinética y la
distribución en tejidos de los inhibidores de CDK, mediante el uso de modelos in vitro
e in vivo, en este último incluyendo diversos modelos de ratones modificados
genéticamente.

Así, el capítulo 5 examina los efectos de los transportadores de eflujo ABCBN y ABCG2,
y de CYPPA4 en la farmacocinética de ribociclib, un inhibidor de CDK4/6. In vitro,
ribociclib fue transportado por ABCBN humano; asimismo, en estudios in vivo, la
penetración cerebral de ribociclib fue drásticamente limitada por la actividad de ABCBN
en la barrera hematoencefálica, no obstante, la coadministración con elacridar pudo
revertir en su totalidad este proceso. Los resultados, además, mostraron que el
transportador ABCBN podría tener un papel importante en la eliminación de ribociclib.
Adicionalmente, este estudio demostró que CYPPA4 puede metabolizar extensivamente
a ribociclib y restringir biodisponibilidad oral de este fármaco. Los conocimientos
generados en este estudio podrían ser útiles para optimizar el uso de ribociclib en la
clínica, especialmente para el tratamiento de tumores cerebrales metastásicos.

Por otra parte, el capítulo 6 investiga si los metabolitos activos de abemaciclib (M2,
M2O y MN8) son sustratos de los transportadores de eflujo ABCBN y ABCG2. Además,
este capítulo establece el impacto de estos transportadores y de la enzima CYPPA en
la farmacocinética y la distribución en tejidos de abemaciclib y de sus metabolitos
activos. En estudios in vitro, abemaciclib fue transportado eficientemente por ABCBN
humano, Abcb2 murino, y ligeramente por ABCG2 humano, asimismo, los metabolitos

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activos de abemaciclib resultaron ser incluso mejores sustratos de estos
transportadores. In vivo, ABCBN y ABCG2 no tuvieron efecto en la exposición plasmática
de abemaciclib y de su metabolito M2O, mientras que el área bajo la curva de 0 a 24
h (AUC ) y la concentración plasmática máxima (C ) de M2 aumentó
0-24h max
significativamente en ausencia de Abcb1a/1b y Abcg2, donde Abcb1a/1b parece tener
un papel más dominante. Asimismo, en ausencia de ambos transportadores, la
penetración cerebral de abemaciclib, M2 y M2O aumentó al menos 25, 4 y 60 veces,
respectivamente, y en menor grado, en ratones deficientes únicamente de un
transportador: Abcb1a/1b o Abcg2. De la misma forma, el recobro de abemaciclib y
sus metabolitos en el lumen intestinal se redujo en gran medida en ratones
Abcb1a1b;Abcg2 , y en menor grado en ratones deficientes de un solo transportador.
-/-
Estos resultados sugieren que ambos transportadores limitan cooperativamente la
penetración cerebral de abemaciclib y sus metabolitos activos, y que, además,
participan en su eliminación hepatobiliar o intestinal directa. Por otra parte, la enzima
CYPPA4 redujo drásticamente la AUC y C plasmática alrededor de 7.5 y 5.6 veces,
0-24h max
respectivamente, y además demostró ser más activa en la formación de M2 y M2O
comparada con la enzima murina Cyp3a. La información generada en este estudio
podría ayudar a optimizar el desarrollo clínico de abemaciclib, especialmente en el
tratamiento de cánceres cerebrales.

El capítulo 7 explora la función de los transportadores de eflujo e influjo ABCBN, ABCG2
y OATPNA/1B, y de la enzima metabolizadora de fármacos CYPPA en la disposición de
milciclib. En los resultados de este estudio, se encontró que milciclib fue transportado
por el Abcg2 murino in vitro, no obstante, los niveles plasmáticos de milciclib no se
alteraron de forma significativa por los transportadores de eflujo, mientras que los
parámetros farmacocinéticos AUC y C fueron alterados mínimamente por
0-24h max
Oatp1a/1b. Por otro lado, milciclib mostró buena penetración cerebral, incluso en los
ratones wild-type (relación cerebro/plasma igual a 1.2), la cual incrementó 5.2 veces
en ausencia ambos transportadores de eflujo (Abcb1 y Abcg2) y, en menor grado, en
ratones deficientes de un sólo transportador. Por último, la AUC plasmática de
0-24h
milciclib aumentó 1.9 veces en ratones Cyp3a , pero únicamente disminuyó 1.3 veces
-/-
ratones con sobreexpresión de la enzima CYPPA4 humana. En resumen, estos datos
indicaron que ABCBN y ABCG2 limitan cooperativamente la penetración cerebral de
milciclib, mientras que los efectos menores de OATPN y CYPPA4 en la farmacocinética
de milciclib podrían ser clínicamente favorables, ya que disminuiría el riesgo de
interacciones fármaco-fármaco no deseadas, o de variaciones interindividuales por la S
actividad de CYPPA4.

Parte III: Farmacocinética y farmacodinamia clínica de los inhibidores de
quinasas dependientes de ciclina
Finalmente, en el capítulo 8 se resume la farmacocinética y la farmacodinamia clínica
de los inhibidores de CDK4/6 aprobados (palbociclib, ribociclib y abemaciclib),

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incluyendo su farmacocinética en poblaciones normales y específicas, así como
también la influencia de algunos factores extrínsecos, como el efecto de los alimentos
y la interacción con otros medicamentos. Algunas similitudes encontradas entre estos
inhibidores de CDK4/6 comprendieron el metabolismo extensivo debido a CYPPA4, su
penetración cerebral limitada por los transportadores de eflujo, y su gran variabilidad
interindividual en niveles plasmáticos. Por otro lado, este capítulo resalta las relaciones
exposición-respuesta y exposición-toxicidad de estos fármacos, en las cuales para
abemaciclib existe una relación exposición-respuesta evidente, mientras que para
palbociclib y ribociclib, los análisis exposición-respuesta permanecen aún inconclusos.
En cuanto a la relación exposición-toxicidad, consistentemente para estos tres
fármacos, la alta exposición está asociada con un riesgo aumentado de neutropenia,
y para ribociclib también con una prolongación del intervalo QT corregido.

En conclusión, los conocimientos aportados en esta tesis sobre los diferentes aspectos
de los inhibidores de CDK podrían ser útiles para optimizar y expandir el uso clínico
de abemaciclib, palbociclib y ribociclib, y asimismo, contribuir potencialmente al
desarrollo clínico de milciclib, esperando que esta información pueda contribuir al
desarrollo de tratamientos con inhibidores de CDK más eficaces y seguros.

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