{"id":15941,"date":"2026-06-12T06:55:59","date_gmt":"2026-06-12T06:55:59","guid":{"rendered":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/portfolio\/sam-neppelenbroek\/"},"modified":"2026-06-12T06:56:07","modified_gmt":"2026-06-12T06:56:07","slug":"sam-neppelenbroek","status":"publish","type":"us_portfolio","link":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/portfolio\/sam-neppelenbroek\/","title":{"rendered":"Sam Neppelenbroek"},"content":{"rendered":"","protected":true},"excerpt":{"rendered":"","protected":true},"author":7,"featured_media":15942,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"us_portfolio_category":[45],"class_list":["post-15941","us_portfolio","type-us_portfolio","status-publish","post-password-required","hentry","us_portfolio_category-new-template"],"acf":{"naam_van_het_proefschift":"Dysregulation of autoreactive B cell responses in autoimmune diseases","samenvatting":"B cellen spelen een belangrijke rol in het humane immuunsysteem doordat ze cruciaal zijn in de bescherming tegen ziekteverwekkers. Om deze bescherming te bieden kunnen B cellen verschillende functies uitvoeren, zoals het produceren van antilichamen die ziekteverwekkers neutraliseren. B cellen hebben de mogelijkheid om tegen vele verschillende microben te reageren, zich aan te passen aan de ziekteverwekker en langdurige immuniteit te genereren. De reactie van B cellen op ziekteverwekkers is sterk gereguleerd, zodat er een effectieve immuunreactie gegenereerd wordt die geen schade aan het lichaam veroorzaakt.\n\nAls de sterke regulatie van B cellen verloren gaat, kunnen er reacties van B cellen tegen het eigen lichaam ontstaan. Deze reacties worden veroorzaakt door autoreactieve B cellen die actief reageren op lichaamseigen structuren. De aanwezigheid van autoreactieve B cel reacties is kenmerkend voor veel auto-immuunziekten. Autoreactieve B cellen spelen waarschijnlijk een belangrijke rol in het ziekteproces van auto-immuunziekten, aangezien therapie\u00ebn die doelgericht B cellen verwijderen effectief zijn in deze ziekten.\n\nSystemische sclerose (SSc) is een auto-immuunziekte waarin autoreactieve B cellen een belangrijke rol spelen. SSc is een complexe ziekte die klinisch gekenmerkt wordt door vasculopathie en fibrose van de huid en interne organen. Alhoewel SSc een zeldzame ziekte is, heeft het een hoge morbiditeit en mortaliteit doordat de functie van verschillende organen sterk kunnen worden aangetast door de ziekte. De klinische presentatie, ernst en progressie van de ziekte verschilt sterk tussen pati\u00ebnten. De behandeling van SSc richt zich met name op het remmen van ziekteprogressie door middel van verschillende medicaties, zoals immunosuppressiva, fibrose inhibitors en autologe stamceltransplantatie.\n\nOm het ontstaan van complicaties van SSc beter te begrepen en effectievere behandelingen te ontwikkelen, is een beter begrip van onderliggende mechanismen van het ziekteproces essentieel. Een belangrijk kenmerk van SSc is de aanwezigheid van autoreactieve B cel reacties die eiwitten uit de kern van lichaamseigen cellen (nucleaire antigenen) herkennen. De aanwezigheid van deze autoreactieve B cellen is sterk geassocieerd met het ontstaan van de ziekte, met specifieke subtypes van de ziekte en met complicaties van de ziekte. Ook zijn therapie\u00ebn gericht op B cellen erg effectief in SSc. Op basis van deze klinische bevindingen is het waarschijnlijk dat autoreactieve B cellen een belangrijke rol spelen in het ziekteproces van SSc.\n\nEen andere auto-immuunziekte waarin autoreactieve B cellen een rol spelen is reumato\u00efde artritis (RA). RA is een veelvoorkomende auto-immuunziekte waarin met name gewrichten worden aangetast door ontstekingsreacties die leiden tot zwelling en pijn. De behandeling van RA richt zich met name op het voorkomen van ontstekingen door immunosuppressiva. Deze medicijnen kunnen de ziekte niet genezen en moeten langdurig ingenomen worden om opvlammingen van de ziekte te voorkomen. Een belangrijk kenmerk van het ziekteproces bij mensen met RA is de aanwezigheid van autoreactieve B cellen gericht tegen gecitrullineerde eiwitten. Deze autoreactieve B cel reactie wordt sterkt geassocieerd met het ontstaan van de ziekte, een verhoogd risico voor ziekte opvlammingen en relatief zeldzaam voorkomen van pati\u00ebnten waarin de ziekte onder controle kan worden gehouden zonder medicatie. Deze klinische associaties zijn een sterke indicatie dat autoreactieve B cellen tegen gecitrullineerde eiwitten een belangrijke rol spelen in RA.\n\nVele aspecten van de verstoorde regulatie van autoreactieve B cel reacties en hun exacte rol in auto-immuunziekten worden nog onvoldoende begrepen. Het doel van deze thesis is om mechanismen te ontrafelen die onderliggend zijn aan het ontstaan, de dynamiek en rol van autoreactieve B cel reacties in auto-immuunziekten. Inzichten in deze mechanismen zijn essentieel om ziekteprocessen in auto-immuunziekten beter te begrijpen. Deze nieuwe inzichten zouden kunnen leiden tot de ontwikkeling van betere behandelingen, tot de identificatie van nieuwe behandelstrategie\u00ebn en uiteindelijk tot mogelijkheden om deze ziekten te voorkomen en genezen.\n\nIn hoofdstuk 1 worden algemene concepten over de regulatie van B cellen ge\u00efntroduceerd. Het begrijpen van deze concepten in de context van beschermende B cel reacties tegen ziekteverwekkers vormt de basis om te kunnen onderzoeken hoe die processen verkeerd gaan bij reacties van B cellen tegen lichaamseigen structuren in auto-immuunziekten. Er zijn verschillende mechanismen tijdens de ontwikkeling en differentiatie van B cellen die de ontwikkeling en differentiatie van autoreactieve B cellen voorkomen. Het doorbreken van deze mechanismen leidt tot het ontstaan van autoreactieve B cel reacties die kenmerkend zijn voor auto-immuunziekten.\n\nHoofdstuk 2 omvat een literatuurstudie over de rol van autoreactieve B cellen in SSc. SSc wordt gekenmerkt door de aanwezigheid van autoreactieve B cel reacties tegen nucleaire antigenen. Autoantilichamen geproduceerd door deze autoreactieve B cel reacties worden vaak gebruikt als klinische biomarkers aangezien ze sterk associ\u00ebren met klinische kenmerken van de ziekte. Deze associaties, samen met het klinische effect van B cel gerichte therapie\u00ebn, wijzen erop dat autoreactieve B cellen waarschijnlijk een belangrijk zijn in het ziekteproces van SSc. Echter, hoe deze B cel reacties ontstaan en bijdragen aan de ziekte is onduidelijk omdat er nog weinig onderzoek is gedaan naar de bijdrage van autoantilichamen en autoreactieve B cellen aan ziekteprocessen in SSc.\n\nHoofdstuk 3 beschrijft een onderzoek waarin autoreactieve B cellen in SSc gekarakteriseerd worden. Dit hoofdstuk richt zich specifiek op B cellen die gericht zijn tegen het nucleaire antigen topoisomerase 1 (TOP1). Deze TOP1-reactieve B cellen hebben een fenotype die typerend is voor sterk geactiveerde B cellen. Daarnaast zijn deze cellen vaak klonaal ge\u00ebxpandeerd. Samen wijzen deze bevindingen op de actieve stimulatie van TOP1-reactieve B cellen in SSc.\n\nHoofdstuk 4 bevat een moleculaire en functionele analyse van antilichamen gericht tegen TOP1 om beter te begrijpen hoe TOP1-reactieve B cellen geactiveerd worden. Door het generen van monoklonale TOP1-reactieve antilichamen werd er een opmerkelijke heterogeniteit gevonden tussen verschillende anti-TOP1 antilichamen van SSc pati\u00ebnten. Een deel van de antilichamen herkent TOP1 namelijk beter wanneer TOP1 gebonden is aan DNA. Een betere herkenning van TOP1-DNA complexen door antilichamen van SSc pati\u00ebnten associeert met anti-TOP1 antilichaam levels en met de ernst van interstiti\u00eble longziekte. Daarnaast worden immunostimulerende eigenschappen van TOP1-reactieve autoantilichamen versterkt door de verbeterde herkenning van TOP1-DNA complexen en be\u00efnvloedt deze herkenning de activatie van TOP1-reactieve B cellen.\n\nIn hoofdstuk 5 wordt een mogelijke rol van microben in het stimuleren van autoreactieve B cellen onderzocht. In dit hoofdstuk wordt er gevonden dat een deel van de autoantilichamen gericht tegen humaan TOP1 ook TOP1 afkomstig van de microbe Saccharomyces cerevisiae kan herkennen. Microbieel TOP1 kan daardoor ook TOP1-reactieve B cellen activeren. Daarnaast komen antilichamen gericht tegen microbieel TOP1 vaker voor in SSc pati\u00ebnten met ernstige ziekte. Deze bevindingen duiden op de mogelijkheid dat microben een belangrijke rol kunnen spelen in het activeren en stimuleren van TOP1-reactieve B cel reacties in SSc.\n\nHoofdstuk 6 beschrijft een onderzoek naar de relatie tussen de dynamiek van autoreactieve B cel reacties gericht tegen gecitrullineerde eiwitten en klinische ziekteactiviteit in RA. Autoreactieve B cellen die gecitrullineerde eiwitten herkennen hebben een sterk geactiveerd fenotype onafhankelijk van de klinische activiteit van de ziekte. Zelfs in pati\u00ebnten waarin verschillende ontstekingsremmers de ziekteactiviteit effectief onderdrukken blijven de autoreactieve B cellen actief. Deze aanhoudende activiteit duidt op de blijvende aanwezigheid van immunologische ziekteactiviteit die eventuele opvlammingen van ziekte zou kunnen veroorzaken en het chronische karakter van RA zou kunnen verklaren.\n\nHoofdstuk 7 beschrijft de ontwikkeling van een methode om autoreactieve B cellen gericht tegen gecitrullineerde eiwitten beter te kunnen identificeren. Sommige antilichaam-producerende B cellen hebben een lage expressie van de B cel receptor op hun oppervlakte, waardoor deze cellen niet aangekleurd kunnen worden met fluorescerend antigen door middel van een oppervlakte kleuring. Om deze cellen toch te kunnen identificeren is er een intracellulaire kleuring met fluorescerend antigen nodig. De ontwikkelde methode kan worden gebruikt om de dynamiek van autoreactieve B cel reacties in auto-immuunziekten beter te kunnen onderzoeken.\n\nIn hoofdstuk 8 worden alle bevindingen uit dit proefschrift op een samenvattende manier beschreven en de relevantie van deze bevindingen voor het begrijpen van de biologie van autoreactieve B cel reacties in reumatische auto-immuunziekten bediscussieerd.","summary":"B cells play an important role in the human immune system as they are crucial in protecting against pathogens. To provide this protection, B cells can perform various functions, such as producing antibodies that neutralize pathogens. B cells have the ability to respond to many different microbes, adapt to the pathogen, and generate long-lasting immunity. The reaction of B cells to pathogens is strictly regulated to ensure an effective immune response is generated without causing damage to the body.\n\nWhen the tight regulation of B cells is lost, reactions against the body's own structures can occur. These reactions are caused by autoreactive B cells that actively respond to the body's own structures. The presence of autoreactive B cell responses is characteristic of many autoimmune diseases. Autoreactive B cells likely play an important role in the disease process of autoimmune diseases, as therapies that specifically target and remove B cells are effective in these diseases.\n\nSystemic sclerosis (SSc) is an autoimmune disease in which autoreactive B cells play an important role. SSc is a complex disease clinically characterized by vasculopathy and fibrosis of the skin and internal organs. Although SSc is a rare disease, it has high morbidity and mortality because the function of various organs can be severely affected by the disease. The clinical presentation, severity, and progression of the disease vary significantly between patients. Treatment for SSc focuses primarily on inhibiting disease progression using various medications, such as immunosuppressants, fibrosis inhibitors, and autologous stem cell transplantation.\n\nTo better understand the onset of complications in SSc and to develop more effective treatments, a better understanding of the underlying mechanisms of the disease process is essential. A key feature of SSc is the presence of autoreactive B cell responses that recognize proteins from the nucleus of the body's own cells (nuclear antigens). The presence of these autoreactive B cells is strongly associated with the onset of the disease, specific disease subtypes, and complications. Furthermore, therapies targeting B cells are very effective in SSc. Based on these clinical findings, it is likely that autoreactive B cells play a significant role in the disease process of SSc.\n\nAnother autoimmune disease in which autoreactive B cells play a role is rheumatoid arthritis (RA). RA is a common autoimmune disease in which joints are primarily affected by inflammatory reactions leading to swelling and pain. Treatment for RA focuses mainly on preventing inflammation through immunosuppressants. These medications cannot cure the disease and must be taken long-term to prevent disease flares. A key feature of the disease process in people with RA is the presence of autoreactive B cells directed against citrullinated proteins. This autoreactive B cell response is strongly associated with the onset of the disease, an increased risk of disease flares, and the relatively rare occurrence of patients whose disease can be controlled without medication. These clinical associations are a strong indication that autoreactive B cells against citrullinated proteins play an important role in RA.\n\nMany aspects of the disturbed regulation of autoreactive B cell responses and their exact role in autoimmune diseases are still insufficiently understood. The aim of this thesis is to unravel mechanisms underlying the onset, dynamics, and role of autoreactive B cell responses in autoimmune diseases. Insights into these mechanisms are essential for a better understanding of disease processes in autoimmune diseases. These new insights could lead to the development of better treatments, the identification of new treatment strategies, and ultimately to possibilities for preventing and curing these diseases.\n\nIn chapter 1, general concepts regarding the regulation of B cells are introduced. Understanding these concepts in the context of protective B cell responses against pathogens forms the basis for investigating how those processes go wrong in B cell reactions against the body's own structures in autoimmune diseases. There are various mechanisms during the development and differentiation of B cells that prevent the development and differentiation of autoreactive B cells. The disruption of these mechanisms leads to the emergence of autoreactive B cell responses characteristic of autoimmune diseases.\n\nChapter 2 comprises a literature study on the role of autoreactive B cells in SSc. SSc is characterized by the presence of autoreactive B cell responses against nuclear antigens. Autoantibodies produced by these autoreactive B cell responses are often used as clinical biomarkers as they strongly associate with clinical features of the disease. These associations, along with the clinical effect of B cell-targeted therapies, suggest that autoreactive B cells are likely important in the disease process of SSc. However, it remains unclear how these B cell responses arise and contribute to the disease because little research has been done on the contribution of autoantibodies and autoreactive B cells to disease processes in SSc.\n\nChapter 3 describes a study in which autoreactive B cells in SSc are characterized. This chapter specifically focuses on B cells directed against the nuclear antigen topoisomerase 1 (TOP1). These TOP1-reactive B cells have a phenotype characteristic of strongly activated B cells. Additionally, these cells are often clonally expanded. Together, these findings point to the active stimulation of TOP1-reactive B cells in SSc.\n\nChapter 4 contains a molecular and functional analysis of antibodies directed against TOP1 to better understand how TOP1-reactive B cells are activated. By generating monoclonal TOP1-reactive antibodies, remarkable heterogeneity was found among different anti-TOP1 antibodies from SSc patients. Specifically, some antibodies recognize TOP1 better when it is bound to DNA. Better recognition of TOP1-DNA complexes by SSc patient antibodies associates with anti-TOP1 antibody levels and the severity of interstitial lung disease. Furthermore, the immunostimulatory properties of TOP1-reactive autoantibodies are enhanced by the improved recognition of TOP1-DNA complexes, and this recognition influences the activation of TOP1-reactive B cells.\n\nIn chapter 5, a possible role for microbes in stimulating autoreactive B cells is investigated. This chapter finds that some autoantibodies directed against human TOP1 can also recognize TOP1 from the microbe Saccharomyces cerevisiae. Microbial TOP1 can thus also activate TOP1-reactive B cells. Additionally, antibodies directed against microbial TOP1 are more common in SSc patients with severe disease. These findings suggest the possibility that microbes may play an important role in activating and stimulating TOP1-reactive B cell responses in SSc.\n\nChapter 6 describes a study on the relationship between the dynamics of autoreactive B cell responses directed against citrullinated proteins and clinical disease activity in RA. Autoreactive B cells recognizing citrullinated proteins have a strongly activated phenotype independent of the clinical activity of the disease. Even in patients where various anti-inflammatory drugs effectively suppress disease activity, the autoreactive B cells remain active. This persistent activity indicates the continuous presence of immunological disease activity that could cause potential disease flares and explain the chronic nature of RA.\n\nChapter 7 describes the development of a method to better identify autoreactive B cells directed against citrullinated proteins. Some antibody-producing B cells have low expression of the B cell receptor on their surface, meaning these cells cannot be stained with fluorescent antigen via surface staining. To identify these cells, intracellular staining with fluorescent antigen is required. The developed method can be used to better investigate the dynamics of autoreactive B cell responses in autoimmune diseases.\n\nIn chapter 8, all findings from this thesis are described in a summarizing manner, and the relevance of these findings for understanding the biology of autoreactive B cell responses in rheumatic autoimmune diseases is discussed.","auteur":"Sam Neppelenbroek","auteur_slug":"sam-neppelenbroek","publicatiedatum":"9 juli 2026","taal":"NL","url_flipbook":"https:\/\/ebook.proefschriftmaken.nl\/ebook\/samneppelenbroek?iframe=true","url_download_pdf":"https:\/\/ebook.proefschriftmaken.nl\/download\/c4f8e708-52a1-47cd-b3eb-e637b2f60da2\/optimized","url_epub":"","ordernummer":"18970","isbn":"978-94-6534-477-5","doi_nummer":"","naam_universiteit":"Universiteit Leiden","afbeeldingen":15943,"naam_student:":"","binnenwerk":"","universiteit":"Universiteit Leiden","cover":"","afwerking":"","cover_afwerking":"","design":""},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/us_portfolio\/15941","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/us_portfolio"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/types\/us_portfolio"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/users\/7"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=15941"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/us_portfolio\/15941\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":15944,"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/us_portfolio\/15941\/revisions\/15944"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/media\/15942"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=15941"}],"wp:term":[{"taxonomy":"us_portfolio_category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/us_portfolio_category?post=15941"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}