{"id":14478,"date":"2026-04-28T07:49:17","date_gmt":"2026-04-28T07:49:17","guid":{"rendered":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/portfolio\/sherril-phyllis\/"},"modified":"2026-04-28T07:49:35","modified_gmt":"2026-04-28T07:49:35","slug":"sherril-phyllis","status":"publish","type":"us_portfolio","link":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/portfolio\/sherril-phyllis\/","title":{"rendered":"Sherril Phyllis"},"content":{"rendered":"","protected":true},"excerpt":{"rendered":"","protected":true},"author":7,"featured_media":14479,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"us_portfolio_category":[45],"class_list":["post-14478","us_portfolio","type-us_portfolio","status-publish","post-password-required","hentry","us_portfolio_category-new-template"],"acf":{"naam_van_het_proefschift":"Wild meat in the city, health risks and implications","samenvatting":"Het gebruik van en de handel in wild vlees kan leiden tot de overdracht van infectieuze pathogenen op menselijke populaties. Dergelijke overdrachten kunnen zich ontwikkelen tot aanhoudende uitbraken in grote steden waar menselijke concentraties de verspreiding ervan kunnen versnellen. Een beter begrip van de werking van stedelijke waardeketens voor wild vlees, de aanwezige gezondheidsrisico's en hun risicobeoordeling zou kunnen helpen bij het beperken van potenti\u00eble overdrachten en uitbraken. We hebben gebruikgemaakt van interviews met sleutelfiguren en literatuuronderzoek om de structuur en werking, de actoren, hun praktijken en de perceptie van gezondheidsrisico's te begrijpen langs een waardeketen voor wild vlees die een snel urbaniserende stad in Afrika bedient: de Nairobi Metropolitan Area (NMA). Ik heb ook 27 monsters van wild vlees uit de NMA (Kenia) geanalyseerd op de aanwezigheid van geselecteerde zo\u00f6notische pathogenen die bekendstaan als veroorzakers van prioritaire ziekten, namelijk E. coli, Brucella spp., Leptospira spp., Coxiella burnetii, het Riftvalleykoortsvirus en het Krim-Congo-hemorragische koortsvirus. Daarnaast hebben we een kwantitatieve microbi\u00eble risicobeoordeling uitgevoerd om de waarschijnlijkheid te schatten dat de verwerking en consumptie van wild vlees door jagers, handelaren en consumenten zou kunnen leiden tot blootstelling aan Shiga-toxine-producerende Escherichia coli (STEC) boven de minimale infectieuze dosis. Ten slotte heb ik een systematisch literatuuronderzoek uitgevoerd van peer-reviewed wetenschappelijke artikelen en World Health Organization-Disease Outbreak News (WHO-DON's) om responsmaatregelen samen te vatten die zijn ge\u00efmplementeerd tijdens vermoedelijke uitbraken via wild vlees in Afrika bezuiden de Sahara van 2004 tot 2024, en heb ik een raamwerk voor uitbraakrespons verstrekt dat is toegesneden op de waardeketen van wild vlees.\n\nHoofdstuk 2 beschrijft de structuur van de waardeketen, het bestuur, de doelsoorten, de ruimtelijke en temporele kenmerken van de waardeketen, evenals de praktijken en kennis van de actoren in de waardeketen op het gebied van gezondheidsrisico's. De waardeketen werkt via drie hoofdknooppunten: jagers, handelaren en consumenten. We ontdekten dat wild vlees wordt geoogst uit peri-urbane gebieden van de NMA, lokaal wordt geconsumeerd of verkocht, of wordt geleverd aan verre stedelijke markten. Actoren rapporteerden een toename in deelname aan de waardeketen tijdens het droge seizoen en tijdens de kerstperiode. De waardeketen functioneerde informeel, waardoor een raamwerk van 'gebruiksregels' ontstond dat gericht was op het vermijden van sancties, terwijl zorgen over voedselveiligheid werden genegeerd. Als gevolg hiervan rapporteerden respondenten dat ze wilde dieren op de blote grond slachtten en wild vlees behandelden met ongewassen blote handen en niet-gereinigd keukengerei. Geen van de actoren in de waardeketen gaf aan persoonlijke beschermingsmiddelen te dragen bij het hanteren van wild vlees. Bij het handelsknooppunt voor verre markten, waar wild vlees werd verkocht vermomd als veevlees, vertoonden vleesverkopers vergelijkbare onveilige praktijken. Actoren hadden een beperkt bewustzijn van de specifieke gezondheidsrisico's van wild vlees.\n\nOp basis van de gerapporteerde gezondheidsrisico's waarmee actoren worden geconfronteerd zoals beschreven in Hoofdstuk 2, rapporteer ik over twee zo\u00f6notische pathogenen in Hoofdstuk 3. De prevalentie van E. coli varieerde van 3,7% tot 40,7%, met EHEC-stx2 (Shiga-toxine-producerende E. coli-2 (STEC-2)) op 40,7% en EHEC-stx1 (Shiga-toxine-producerende E. coli-1 (STEC-1)) op 29,6%. Enteroaggregatieve E. coli had een prevalentie van 3,7%, terwijl ETEC-elt, ETEC-stl en C. burnetii elk een prevalentie hadden van 7,4%. De aanwezigheid van E. coli in de monsters van wild vlees ondersteunt de gegevens in Hoofdstuk 2, waar actoren melding maakten van darmaandoeningen, waaronder bloederige diarree, als enkele van de ziekten die zij in het verleden hebben ervaren na hun interactie met wild vlees. Geen van de monsters was positief voor Brucella spp., Leptospira spp., en de virale pathogenen Riftvalleykoortsvirus en Krim-Congo-hemorragische koortsvirus.\n\nHoofdstukken 2 en 3 boden ons dus overtuigend bewijs voor het bestaan van E. coli als gezondheidsrisico langs de waardeketen van wild vlees in de NMA, wat leidde tot onze risicobeoordeling. Ik schatte de waarschijnlijkheid van blootstelling van jagers en consumenten aan STEC (zowel 1 als 2) boven de minimale infectieuze dosis op respectievelijk 0,43 (gemiddelde = 0,43) en 0,27 (gemiddelde = 0,31), wat suggereert dat alle actoren risico lopen op blootstelling aan STEC via wild vlees. De waarschijnlijkheid van blootstelling van de consument aan STEC boven de infectieuze dosis werd geschat op 0,03 (gemiddelde = 0,04). Bij alle beoordeelde knooppunten in de waardeketen werd het risico op blootstelling sterk bepaald door de waarschijnlijkheid dat wild vlees STEC-positief was voor jagers, handelaren en consumenten (Spearman's rangorde-correlatieco\u00ebffici\u00ebnt (\u03c1) = 0,95, 1,0 en 0,89), vergeleken met andere modelinvoer.\n\nIn Hoofdstuk 5 richtte ik me op uitbraakrespons als een van de contexten waarin onze gegevens kunnen worden benut. We hebben 84 ziekte-uitbraakgebeurtenissen onderzocht die werden veroorzaakt door vier zo\u00f6notische virussen: Ebola (n=32), Marburg (n=11), Lassa (n=19), Mpox (n=20) en \u00e9\u00e9n bacterie: Bacillus anthracis (n=2). Deze gebeurtenissen werden waargenomen in 24 landen, met de meeste uitbraken gerapporteerd in de Democratische Republiek Congo (n=20). Op nationaal niveau bestond de respons uit surveillance bij mensen via contactonderzoek, casemanagement en mitigatie van de verspreiding van ziekten door middel van vaccinaties, publieke voorlichting over infectiepreventie en -beheersing, en verboden op het gebruik van wild vlees. De nationale respons werd ondersteund door de internationale gemeenschap. Op persoonlijk niveau hebben gemeenschappen de voorgestelde infectiepreventie- en beheersingsmaatregelen al dan niet overgenomen. Ze stopten, verminderden of zetten het oogsten, de verkoop en de consumptie van wild vlees voort, afhankelijk van hun kennis van de uitbraak en de richtlijnen van de gezondheidsautoriteiten. We stelden een raamwerk voor voor sociaal verantwoorde responsmaatregelen die zijn toegesneden op de behoeften en aard van de waardeketens van wild vlees in Afrika bezuiden de Sahara.\n\nHet hoofddoel van deze studie was om het risico op blootstelling van actoren in de waardeketen aan de gezondheidsrisico's langs een stedelijke waardeketen voor wild vlees in te schatten. We laten zien dat deze actoren inderdaad te maken krijgen met gezondheidsrisico's bij het oogsten, verwerken, verkopen en consumeren van wild vlees. Deze risico's worden verder vergroot door hun onveilige en onhygi\u00ebnische praktijken bij het omgaan met wild vlees. Deze actoren vormen dus een potenti\u00eble bron van overdracht van wildvlees-gerelateerde pathogenen en infectieziekte-uitbraken binnen de stedelijke bevolking. De gegevens die we uit dit onderzoek verstrekken, kunnen worden gebruikt als bewijs op basis waarvan gezondheidsbeleid gericht op het beperken van gezondheidsrisico's, zoals ziekte-uitbraken, door wild vlees kan worden ontworpen en ge\u00efmplementeerd. Onze gegevens zijn met name van belang bij het voorbereiden op, voorkomen van, reageren op en herstellen van ziekte-uitbraken door wild vlees, een waarschijnlijke bron van de volgende pandemie.","summary":"Consumption of and trade in wild meat could result in infectious pathogen spillover into human populations. Such spillovers could propagate into sustained outbreaks in major cities where human aggregations potentially catalyze their spread. A better understanding of how urban wild meat value chains operate, the health hazards present and their risk assessment could assist in mitigating potential spillovers and outbreak events. We used key informant interviews and literature reviews to understand the structure and operations, actors, their practices, and health risk perceptions along a wild meat value chain supplying a rapidly urbanizing city in Africa, the Nairobi Metropolitan Area (NMA). I also analyzed 27 wild meat samples obtained from the Nairobi Metropolitan Area (NMA), Kenya, for the presence of selected zoonotic pathogens known to cause priority diseases namely E. coli, Brucella spp., Leptospira spp., Coxiella burnetii, Rift valley fever virus and Crimean Congo hemorrhagic fever virus. In addition, we conducted a quantitative microbial risk assessment to estimate the probability that handling and consumption of wild meat by hunters, traders and consumers could lead to exposure to Shiga toxin producing Escherichia coli (STEC) above the minimum infectious dose. Finally, I conducted a systematic literature review of peer-reviewed scientific articles and World Health Organization-Disease Outbreak News (WHO-DONs) to summarize response measures that have been implemented during suspected wild meat-borne outbreaks in Sub-Saharan Africa from 2004 to 2024 and provide an outbreak response framework tailored for the wild meat value chain.\n\nChapter 2 outlines the value chain structure, its governance, animals targeted, the spatial and temporal characteristics of the value chain as well as the value chain actors\u2019 health risk practices and knowledge. The value chain operates via three main nodes: harvester, trader, and consumer nodes. We found wild meat to be harvested from peri-urban areas of the NMA, consumed or sold locally, or supplied to distant urban markets. Actors reported increased participation along the value chain during the dry season, and over the Christmas period. The value chain operated informally, creating a \u2018rules in use\u2019 framework focusing on sanction avoidance, while ignoring food safety concerns. Consequently, respondents reported slaughtering wild animals on the bare ground, handling wild meat with unwashed bare hands and uncleaned utensils. No value chain actors reported wearing personal protective equipment when handling wild meat. At the distant markets\u2019 trader node where wild meat was sold disguised as livestock meat, meat vendors engaged in similar unsafe practices. Actors had limited awareness of the specific health hazards from wild meat.\n\nBased on the reported health hazards faced by actors as outlined in Chapter 2, I report on two zoonotic pathogens in Chapter 3. The prevalence of E. coli ranged from 3.7%-40.7% with EHEC-stx2 (Shiga toxin producing E. coli-2 (STEC-2)) at 40.7% (95% CI: 24.5-59.3%) and EHEC-stx1(Shiga toxin producing E. coli-1 (STEC-1)) at 29.6% (95% CI: 15.9-48.5%). Enteroaggregative E. coli had a prevalence of 3.7% (95% CI: 0.7-18.3%) while ETEC-elt, ETEC-stl and C. burnetii had a prevalence of 7.4% (95% CI: 2.1-23.4 %). The presence of E. coli on the wild meat samples supports the data in Chapter 2 where actors reported enteric illnesses, including bloody diarrhea as some of the illnesses they have experienced in the past following their interaction with wild meat. None of the samples were positive for Brucella spp., Leptospira spp., and the viral pathogens Rift Valley Fever Virus and Crimean Congo Hemorrhagic Fever Virus.\n\nChapters 2 and 3 thus provided us with compelling evidence of the existence of E.coli as a health hazard along the wild meat value chain in the NMA, guiding our risk assessment. I estimated the probability of hunters and consumers exposure to STEC (both 1 and 2) above the minimum infectious dose at 0.43 (mean= 0.43; 95% CI= 0.24-0.63) and 0.27 (mean= 0.31; 95% CI= 0.08-0.60) respectively, suggesting that all actors risk exposure to wild meat-borne STEC. The probability of consumer exposure to STEC above the infectious dose was estimated at 0.03 (mean= 0.04; 95% CI= 0.009-0.08). Across all the value chain nodes assessed, the risk of exposure was strongly driven by the likelihood of wild meat being STEC positive for hunters, traders and consumers (Spearman\u2019s rank-order correlation coefficient (\u03c1) = 0.95, 1.0 and 0.89, respectively), compared to other model inputs.\n\nIn Chapter 5, I focused on outbreak response as one of the contexts in which our data can be leveraged. We considered 84 disease outbreak events caused by four zoonotic viruses: Ebola (n=32), Marburg (n=11), Lassa (n=19), Mpox (n=20) and one bacterium: Bacillus anthracis (n=2). These events were observed across 24 countries, with the highest outbreaks reported in the Democratic Republic of the Congo (n=20). At the national level, responses involved human surveillance via contact tracing, case management and mitigation of the disease spread through vaccinations, public education on infection prevention and control, and bans on wild meat use, amongst others. National response was supported by the international community. At personal level, communities either adopted, or not, the proposed infection prevention and control measures. They either stopped, reduced or continued harvesting, sale and consumption of wild meat depending on their knowledge of the outbreak, and the directives issued by the health authorities. We proposed a framework for socially responsive response measures tailored to the needs and nature of wild meat value chains in Sub-Saharan Africa.\n\nThe main aim of this study was to estimate the risk of exposure of value chain actors to the health hazards along an urban wild meat value chain. We show that these actors indeed face health hazards as they harvest, process, sell and consume wild meat. These risks are further augmented by their unsafe and unhygienic practices while handling wild meat. These actors are thus a potential source of wild meat-borne pathogen spillovers and infectious disease outbreaks within the urban population. The data we provide from this study can be used as evidence against which health policies towards mitigating health risks, such as disease outbreaks, from wild meat can be designed and implemented. Our data is particularly important in preparing for, preventing, responding to and recovering from disease outbreaks from wild meat, a likely source of the next pandemic.","auteur":"Sherril Phyllis","auteur_slug":"sherril-phyllis","publicatiedatum":"1 juni 2026","taal":"EN","url_flipbook":"https:\/\/ebook.proefschriftmaken.nl\/ebook\/sherrilphyllis?iframe=true","url_download_pdf":"https:\/\/ebook.proefschriftmaken.nl\/download\/a1a03ffb-2441-41fc-90fc-860f28c7d3ee\/optimized","url_epub":"","ordernummer":"18794","isbn":"","doi_nummer":"","naam_universiteit":"Wageningen University","afbeeldingen":14480,"naam_student:":"","binnenwerk":"","universiteit":"Wageningen University","cover":"","afwerking":"","cover_afwerking":"","design":""},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/us_portfolio\/14478","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/us_portfolio"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/types\/us_portfolio"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/users\/7"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=14478"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/us_portfolio\/14478\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":14481,"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/us_portfolio\/14478\/revisions\/14481"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/media\/14479"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=14478"}],"wp:term":[{"taxonomy":"us_portfolio_category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/us_portfolio_category?post=14478"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}