{"id":10669,"date":"2026-04-09T14:32:56","date_gmt":"2026-04-09T14:32:56","guid":{"rendered":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/portfolio\/simon-isaiah\/"},"modified":"2026-04-23T07:20:23","modified_gmt":"2026-04-23T07:20:23","slug":"simon-isaiah","status":"publish","type":"us_portfolio","link":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/portfolio\/simon-isaiah\/","title":{"rendered":"Simon Isaiah"},"content":{"rendered":"","protected":false},"excerpt":{"rendered":"","protected":false},"author":8,"featured_media":12520,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"us_portfolio_category":[45],"class_list":["post-10669","us_portfolio","type-us_portfolio","status-publish","has-post-thumbnail","hentry","us_portfolio_category-new-template"],"acf":{"naam_van_het_proefschift":"Urinary metabolomic profiling for characterization, diagnosis and treatment response in paediatric tuberculous meningitis","samenvatting":"In dit proefschrift doen we verslag van verschillende studies over tuberculeuze meningitis (TBM) bij kinderen. Onze focus ligt bij het in kaart brengen van het zogenaamde urine metabool (= stofwisseling) profiel van kinderen met deze ziekte. Het doel is om de behandelingsrespons beter te begrijpen, evenals de interacties tussen de ziekteverwekker Mycobacterium tuberculosis (M. tb) en de gastheer, en hoe dit verband houdt met de ernst van de infectie. Om deze pathogeen-gastheerinteracties te begrijpen, is het belangrijk om te erkennen dat het moeilijk is om TBM in een vroeg stadium te diagnosticeren, vanwege de aspecifieke symptomen van algemene malaise, koorts en gewichtsverlies. Met het urine metaboloom van de ge\u00efnfecteerde gastheer, trachten we specifieke metabolieten toe te wijzen aan metabole routes van zowel de gastheer als de ziekteverwekker.\n\nVolgens de Wereldgezondheidsorganisatie (WHO) vond 23% van de nieuwe gevallen van tuberculose wereldwijd plaats in de Afrikaanse regio, het op \u00e9\u00e9n na hoogste percentage wereldwijd. Zuid-Afrika is een van de landen met de hoogste prevalentie van tuberculose ter wereld. TBM is de ernstigste vorm van tuberculose en is verantwoordelijk voor naar schatting 20% van de tuberculose-gerelateerde sterfgevallen in Zuid-Afrika (Hoofdstuk 1). Er is echter momenteel een gebrek aan kennis over de wereldwijde impact van pediatrische TBM. Leeftijd wordt beschouwd als de belangrijkste risicofactor voor de ontwikkeling van TBM en komt het meest voor bij kinderen van 0 tot 4 jaar. Kinderen jonger dan 2 jaar met onbehandelde tuberculose ontwikkelen doorgaans TBM. De reden waarom kinderen kwetsbaarder zijn voor TBM, is hun nog onderontwikkelde immuunsysteem. Kinderen kunnen afhankelijk van de ziektestadia verschillende symptomen vertonen. Deze verschillen zijn een reflectie van verschillen in immuunrespons en andere gastheerfactoren. TBM is dus een ernstig gezondheidsprobleem in Zuid-Afrika en vormt een bijzonder gevaar voor zuigelingen en jonge kinderen. Het is bekend dat TBM bij kinderen gepaard gaat met neurologische complicaties. Vroege diagnose en behandeling kunnen echter de overlevingskansen aanzienlijk verhogen. De gouden standaard voor een zekere of definitieve diagnose van TBM vereist een positieve kweek van M. tb uit cerebrospinale vloeistof (CSV), verkregen via een lumbaalpunctie. De afwezigheid van een detecteerbare hoeveelheid bacteri\u00ebn en de beperkte mogelijkheid om bij ernstig zieke kinderen CSV af te nemen, bemoeilijken de bevestiging van M. tb. Daarom blijft de diagnose van TBM een uitdaging, waarbij veel gevallen indirect worden vastgesteld via klinische beoordelingen, biochemische afwijkingen in CSV en hersenbeeldvorming. We noemen dat, in tegenstelling tot definitieve TBM, waarschijnlijke TBM. Dit benadrukt de noodzaak van een niet-invasieve betrouwbare diagnostische aanpak om snel tot een zekere diagnose te komen, vooral voor kinderen.","summary":"The primary hypothesis formulated for this investigative study is: \u2018Can urinary metabolic profiles of paediatric cases of tuberculous meningitis (TBM) provide sufficient metabolic information to characterise and diagnose TBM, and monitor treatment response, thereafter?\u2019 Secondly, if a brain\u2013gut axis exists, then chronic central nervous system (CNS) bacterial infection(s) should theoretically be reflected in the urine. The premise here is that chronic CNS bacterial infection(s) will affect the gut microbiome and that altered metabolism in both the CNS and the gut will release metabolites into the blood that are filtered (kidneys) and excreted in the urine. Upon extensive deliberation and contemplation regarding the elucidation of the hypothesis, specific objectives became clear for this study:\n\n(I) Characterise the urinary metabolic profile of the patient with TBM to comprehensively understand the aetiology, pathogenesis, clinical manifestations, epidemiology, and prognosis of the disease.\n(II) Identify metabolite profiles that characterise the three stages of severity of TBM and potential biosignatures for early diagnosis of the disease, which may lead to a better outcome.\n(III) Monitor the patients\u2019 responses to treatment and identify possible prognostic markers to predict a successful treatment outcome.\n\nThe structure of this thesis follows. Chapter 1 is a literature overview of existing knowledge of Mycobacterium tuberculosis (M. tb), with a focus on the brain\u2013gut axis exposed to chronic bacterial Infections in the central nervous system (CNS), underscoring the significance of the brain\u2013gut axis within the realm of chronic bacterial infections in the CNS with concise step-by-step pathological aspects of M. tb in term of CNS infection. A brief description of the existing literature provides a complete overview of chronic bacterial infections of the CNS with a central focus on tuberculous meningitis (TBM), as well as the impact of bacterial infection on the gut microbiome and the potential application of urinary metabolic profiling for the diagnosis of M. tb infections. Infection with M. tb leads to perturbed metabolism in both the CNS and gut and will release metabolites into the blood that are filtered (by the kidneys) and excreted in the urine. Identifying the gap in the literature: no non-invasive (urinary) method of diagnosis of TBM (problem statement), showed that the association between the brain-intestinal connection and bacterial infections of the CNS is relatively scarce in the current literature. The intricate relationships with the gut microbiota are still inadequately elucidated. Metabolomics as a scientific method of choice was selected to fill this gap. But","auteur":"Simon Isaiah","auteur_slug":"simon-isaiah","publicatiedatum":"24 juni 2025","taal":"NL","url_flipbook":"https:\/\/ebook.proefschriftmaken.nl\/ebook\/simonisaiah?iframe=true","url_download_pdf":"","url_epub":"","ordernummer":"FTP-202604091429","isbn":"978-94-6510-652-6","doi_nummer":"","naam_universiteit":"Vrije Universiteit Amsterdam","afbeeldingen":12520,"naam_student:":"","binnenwerk":"","universiteit":"Vrije Universiteit Amsterdam","cover":"","afwerking":"","cover_afwerking":"","design":""},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/us_portfolio\/10669","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/us_portfolio"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/types\/us_portfolio"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/users\/8"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=10669"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/us_portfolio\/10669\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":10672,"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/us_portfolio\/10669\/revisions\/10672"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/media\/12520"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=10669"}],"wp:term":[{"taxonomy":"us_portfolio_category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.proefschriftmaken.nl\/en\/wp-json\/wp\/v2\/us_portfolio_category?post=10669"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}